Para cargar baterías 3S de dos en dos, necesitas por narices un cargador de 6S como mínimo.
Pero de todas maneras, no compensa. Salvo que se utilicen las 3S de dos en dos (en un 500, por ejemplo), NO compensa el cargarlas a la vez. Tarda mucho más que en cargarlas de una en una.
Yo me compré un adaptador para el cargador para cargar de 2 en 2 y tarda mucho balanceandolas luego. Porque al estar descargadas de distintas, incluso puede dar error el cargador y decir que 3 celdas están mal.