La mayoría lo lleva como tú, debajo de las baterías, de querer refrijerarlo lo ideal mas que ponerlo en un lateral es meterlo dentro del heli, debajo de las coronas (oneway o algo así se llaman). Estas coronas tienen unas especie de helices que al girar echan aire hacia abajo, así refrigeraría el variador mejor. En el lateral del heli no te lo recomiendo, en caso de caida estaría mas desprotegido.
El bec... no sé exactamente que es, sólo que va unido al variador, a mi entender es como una especie de "transformador" para cambiar el voltaje, pero no estoy muy seguro, que te contesten los maestros mejor.