Pues yo te diría que tienes algún componente en cortocircuito, y mas concretamente el motor, ya que si fuera el variador se calentarían este y la lipo, no el motor. Si el motor está en corto, explica que se caliente la lipo, el variador y el motor.
Revisa las conexiones del motor, y si puedes, prueba con otro.
Saludos