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Qué marca de emisor/receptor utilizas?Cómo alimentas el receptor?A qué tension?
Que el variador te meta picos de consumo, eso es para las lipo del motor, pero en ningún caso debería dejar al heli sin control, ya que llevas la alimentación de la electrónica separada. Yo comprobaría el bec, si te da el voltaje correcto. Tanto en vacío como moviendo los servos del heli. También comprobaría el interruptor del bec, ya que no es el primer caso que falla.
Los condensadores http://www.centrorclevante.net/index.php?main_page=product_info&cPath=153_123&products_id=4888 Son para prevenir que un pico de consumo, baje el voltaje y se resetee el receptor. Comprueba los servos no sea que uno se enganche y sea el que provoque el consumo.
El condensador puedes ponerlo en cualquier canal que tengas libre o si no tienes, con una "Y" en el canal del BEC.